Ensemble dynamics and information flow deduction from whole-brain imaging data
Yu Toyoshima; Hirofumi Sato; Daiki Nagata; Manami Kanamori; Moon Sun Jang; Koyo Kuze; Suzu Oe; Takayuki Teramoto; Yuishi Iwasaki; Ryo Yoshida; Takeshi Ishihara; Yuichi Iino, The recent advancements in large-scale activity imaging of neuronal ensembles offer valuable opportunities to comprehend the process involved in generating brain activity patterns and understanding how information is transmitted between neurons or neuronal ensembles. However, existing methodologies for extracting the underlying properties that generate overall dynamics are still limited. In this study, we applied previously unexplored methodologies to analyze time-lapse 3D imaging (4D imaging) data of head neurons of the nematode Caenorhabditis elegans. By combining time-delay embedding with the independent component analysis, we successfully decomposed whole-brain activities into a small number of component dynamics. Through the integration of results from multiple samples, we extracted common dynamics from neuronal activities that exhibit apparent divergence across different animals. Notably, while several components show common cooperativity across samples, some component pairs exhibited distinct relationships between individual samples. We further developed time series prediction models of synaptic communications. By combining dimension reduction using the general framework, gradient kernel dimension reduction, and probabilistic modeling, the overall relationships of neural activities were incorporated. By this approach, the stochastic but coordinated dynamics were reproduced in the simulated whole-brain neural network. We found that noise in the nervous system is crucial for generating realistic whole-brain dynamics. Furthermore, by evaluating synaptic interaction properties in the models, strong interactions within the core neural circuit, variable sensory transmission and importance of gap junctions were inferred. Virtual optogenetics can be also performed using the model. These analyses provide a solid foundation for understanding information flow in real neural networks., Public Library of Science (PLoS)
PLOS Computational Biology, 15 Mar. 2024, [Reviewed]

Neuron ID dataset facilitates neuronal annotation for whole-brain activity imaging of C. elegans
Yu Toyoshima; Stephen Wu; Manami Kanamori; Hirofumi Sato; Moon Sun Jang; Suzu Oe; Yuko Murakami; Takayuki Teramoto; ChanHyun Park; Yuishi Iwasaki; Takeshi Ishihara; Ryo Yoshida and Yuichi Iino, BACKGROUND: Annotation of cell identity is an essential process in neuroscience that allows comparison of cells, including that of neural activities across different animals. In Caenorhabditis elegans, although unique identities have been assigned to all neurons, the number of annotatable neurons in an intact animal has been limited due to the lack of quantitative information on the location and identity of neurons. RESULTS: Here, we present a dataset that facilitates the annotation of neuronal identities, and demonstrate its application in a comprehensive analysis of whole-brain imaging. We systematically identified neurons in the head region of 311 adult worms using 35 cell-specific promoters and created a dataset of the expression patterns and the positions of the neurons. We found large positional variations that illustrated the difficulty of the annotation task. We investigated multiple combinations of cell-specific promoters driving distinct fluorescence and generated optimal strains for the annotation of most head neurons in an animal. We also developed an automatic annotation method with human interaction functionality that facilitates annotations needed for whole-brain imaging. CONCLUSION: Our neuron ID dataset and optimal fluorescent strains enable the annotation of most neurons in the head region of adult C. elegans, both in full-automated fashion and a semi-automated version that includes human interaction functionalities. Our method can potentially be applied to model species used in research other than C. elegans, where the number of available cell-type-specific promoters and their variety will be an important consideration.
BMC Biology, 19 Mar. 2020, [Reviewed]

An annotation dataset facilitates automatic annotation of whole-brain activity imaging of C. elegans
Yu Toyoshima; Stephen Wu; Manami Kanamori; Hirofumi Sato; Moon Sun Jang; Suzu Oe; Yuko Murakami; Takayuki Teramoto; ChanHyun Park; Yuishi Iwasaki; Takeshi Ishihara; Ryo Yoshida; Yuichi Iino, Annotation of cell identity is an essential process in neuroscience that allows for comparing neural activities across different animals. In C. elegans, although unique identities have been assigned to all neurons, the number of annotatable neurons in an intact animal is limited in practice and comprehensive methods for cell annotation are required. Here we propose an efficient annotation method that can be integrated with the whole-brain imaging technique. We systematically identified neurons in the head region of 311 adult worms using 35 cell-specific promoters and created a dataset of the expression patterns and the positions of the neurons. The large positional variations illustrated the difficulty of the annotation task. We investigated multiple combinations of cell-specific promoters to tackle this problem. We also developed an automatic annotation method with human interaction functionality that facilitates annotation for whole-brain imaging., Cold Spring Harbor Laboratory
10 Jul. 2019

Measuring Spatiotemporal Dynamics of Odor Gradient for Small Animals by Gas Chromatography
Akiko Yamazoe-Umemoto; Yuishi Iwasaki and Koutarou D. Kimura
Bio-protocol, 05 Apr. 2018, [Reviewed]

Calcium dynamics regulating the timing of decision-making in C. elegans
Yuki Tanimoto; Akiko Yamazoe-Umemoto; Kosuke Fujita; Yuya Kawazoe; Yosuke Miyanishi; Shuhei J. Yamazaki; Xianfeng Fei; Karl Emanuel Busch; Keiko Gengyo-Ando; Junichi Nakai; Yuichi Lino; Yuishi Iwasaki; Koichi Hashimoto; Koutarou D. Kimura
ELIFE, May 2017, [Reviewed]

Large Graph Laplacian Matrix and Functional Map of Whole Brain of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Hiromu Sakuma; Takayuki Teramoto; Sayuri Kuge; Takeshi Ishihara; Yuishi Iwasaki, Corresponding
Proceedings of 2016 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications, 27 Nov. 2016, [Reviewed]

Modulation of different behavioral components by neuropeptide and dopamine signalings in non-associative odor learning of Caenorhabditis elegans
Akiko Yamazoe-Umemoto; Kosuke Fujita; Yuichi Lino; Yuishi Iwasaki; Koutarou D. Kimura
NEUROSCIENCE RESEARCH, Oct. 2015, [Reviewed]

Evaluation of head movement periodicity and irregularity during locomotion of Caenorhabditis elegans
Ryuzo Shingai; Morimichi Furudate; Katsunori Hoshi; Yuishi Iwasaki
FRONTIERS IN BEHAVIORAL NEUROSCIENCE, Mar. 2013, [Reviewed]

Effective Modeling of a Partial Neural Network of C. elegans: Theory and Application　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki
Abstracts of the 2nd International Conference on Brain-Inspired Information Technology, 08 Oct. 2005, [Reviewed]

Stochastic Formulation for a Partial Neural Circuit of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki; Sohei Gomi, Lead
Bulletin of Mathematical Biology, Jul. 2004

Time Series Analysis Based on Transition Probability: Prediction from the Viewpoint of Path Integrals
Y. Iwasaki
Proceedings of The 2nd International Symposium on Frontiers of Time Series Modeling, Dec. 2000

Numerical Study on Error Catastrophe of Adaptive Mutants and Their Stability
Y Iwasaki; F Yonezawa, Lead
Journal of Physical Soicety of Japan, May 1999

A simple model of asymmetric quasi-species : network sustained by emergent high mutation rates
Y Iwasaki; F Yonezawa, Lead
Physica D, Feb. 1999

Autonomous adaptation driven by point mutation in genetic algorithms　　　　　　　　　　　　　　　
Lead
Japanese Journal of Computer Science, Dec. 1997

Genetic Evolution through Stochastic Mutation
Y Iwasaki; F Yonezawa, Lead
Proceedings of IEEE International Conference on Evolutionary Computation, May 1996, [Reviewed]

データ同化によって線虫の神経回路をまるごと読み解く 〜現状と課題
徳永 旭将; 吉田 亮; 岩崎 唯史
シミュレーション, 15 Dec. 2013

Prediction of synaptic properties of neural network of Caenorhabditis elegans
Kazumi Sakata; Hiroki Akita; Yuishi Iwasaki; Tokumitsu Wakabayashi and Tarou Ogurusu
Proceedings of SICE 2012, 20 Aug. 2012, [Reviewed]

C. elegans maintain their response to the repulsive odor 2-nonanone during avoidance behavior
Akiko Yamazoe; Yuishi Iwasaki; Kotaro Kimura
NEUROSCIENCE RESEARCH, 2011

Database of Synaptic Connectivity of C. elegans for Computation
K. Oshio; Y. Iwasaki; S. Morita; Y. Osana; S. Gomi; E. Akiyama; K. Omata; K. Oka and K. Kawamura
Technical Report of CCeP, Keio Future, Keio University, Dec. 2003

経路積分法を用いた時系列解析 -統計的モデルのパラメータ推定-　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎 唯史
IEICE Technical Report, Jul. 2002

A model of Molecular Evolution with meta-adaptive mechanism　　　　　　　　　　　　　　　
Bussei Kenkyu, Aug. 1996

Prediction of Chaotic trajectory based on transition probability　　　　　　　　　　　　　　　
Bussei Kenkyu, Mar. 1995
Lead

Stability against noise at edge of chaos and window　　　　　　　　　　　　　　　
Bussei Kenkyu, Mar. 1995

Effective Modeling of a Partial Neural Network of C.elegans: Theory and Application　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki, Single work
International Congress Series, Jun. 2006

Spatio-temporal model of neural dynamics in C. elegans considering its local connectome　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki
第48回日本分子生物学会年会, 05 Dec. 2025
20251203, 20251205

局所的コネクトームを考慮した線虫の神経系に関する時空間モデリング　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史
日本物理学会 第80回年次大会, 17 Sep. 2025
20250916, 20250919

線虫における神経筋系の屈曲制御モデル：頭部神経ユニットの影響を考慮した蛇行運動制御　　　　　　　　　　　　　　　
北川颯眞; 岩崎唯史
日本物理学会 第79回年次大会, 17 Sep. 2024
20240916, 20240919

〔Major achievements〕Estimation of functional neuron ensembles for whole-brain activity data in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
竹下晴山; 木村俊; 竹田晃人; 岩崎唯史
第61回日本生物物理学会年会, 16 Nov. 2023, 日本生物物理学会
20231114, 20231116

〔Major achievements〕Nonlinear neural circuit model of stochastic behavioral choice in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
福井真; 岩崎唯史
第61回日本生物物理学会年会, 15 Nov. 2023, 日本生物物理学会
20231114, 20231116

確率的ブロックモデルに基づく時系列信号クラスタ推定　　　　　　　　　　　　　　　
木村俊; 竹下晴山; 岩崎唯史; 竹田晃人
第26回情報論的学習理論ワークショップ, 30 Oct. 2023, 電子情報通信学会
20231029, 20231101

活動同期性に基づく確率的ブロックモデルによる神経クラスタ推定　　　　　　　　　　　　　　　
木村俊; 竹下晴山; 岩崎唯史; 竹田晃人
日本物理学会 第78回年次大会, 17 Sep. 2023, 日本物理学会
20230916, 20230919

生物学的知見に基づいた線虫の神経筋系の屈曲制御モデル　　　　　　　　　　　　　　　
東悠太; 小笹祐哉; 岩崎唯史
日本機械学会2023年茨城講演会, 18 Aug. 2023, 日本機械学会
20230818, 20230818

Eliminating spurious correlation in neural activity analysis of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
竹下晴山; 岩崎唯史
第60回日本生物物理学会年会, 30 Sep. 2022, 日本生物物理学会
20220928, 20220930

線虫の神経系制御機構の理解に向けた数理モデリングと全脳活動データ解析　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史
第2回分子サイバネティクス研究会, 10 May 2021, [Invited]
20210510, 20210510

線虫の全中枢神経細胞活動データに対する重複クラスタ解析：機能的なHubニューロンの探索　　　　　　　　　　　　　　　
加藤禎規; 佐藤博文; 豊島有; 大江紗; 寺本孝行; Stephen Wu; 徳永旭将; 吉田亮; 石原健; 飯野雄一; 岩崎唯史
日本物理学会 第76回年次大会, 13 Mar. 2021, 日本物理学会
20210312, 20210315

Whole-brain imaging reveals dynamical structure of neural signaling in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Taichi Isaka; Naoyuki Nemoto; Hirofumi Sato; Yu Toyoshima; Suzu Oe; Yuko Murakami; Takayuki Teramoto; Stephen Wu; Terumasa Tokunaga; Moon-Sun Jang; Manami Kanamori; Ryo Yoshida; Takeshi Ishihara; Yuichi Iino and Yuishi Iwasaki
20th International Conference on Systems Biology, 04 Nov. 2019
20191101, 20191105

How do graded neurons generate stochastic binary switching dynamics in C. elegans?　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki
第57回日本生物物理学会年会, 24 Sep. 2019, 日本生物物理学会年
20190924, 20190926

線虫の膜電位における確率的遷移と行動選択　　　　　　　　　　　　　　　
阿部幸太; 岩崎唯史
日本物理学会 2019年秋季大会, 13 Sep. 2019, 日本物理学会

線虫の全中枢神経細胞活動データの時系列解析：因果ダイアグラムの時間変化　　　　　　　　　　　　　　　
根本尚之; 井坂太一; 佐藤博文; 豊島有; 大江紗; 村上悠子; 寺本孝行; Stephen Wu; 徳永旭将; ジャン ムンソン; 吉田亮; 石原健; 飯野雄一; 岩崎唯史
日本物理学会 2019年秋季大会, 11 Sep. 2019, 日本物理学会

線虫の全脳活動データ解析： 使っているシナプス結合と使っていないシナプス結合　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史; 佐藤博文; 豊島有; 大江紗; 村上悠子; 寺本孝行; Stephen Wu; 徳永旭将; ジャン ムンソン; 吉田亮; 石原健; 飯野雄一
日本物理学会 第74回年次大会, 16 Mar. 2019, 日本物理学会

Stochastic binary switching behavior of nonlinear neuron explains different responses to same stimulation in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki and Kota Abe
The 19th International Conference on Systems Biology, 28 Oct. 2018

Robustness of synaptic pathway and signaling pathway estimated from the whole-brain activity data in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史; 佐藤博文; 大江紗; 久下小百合; 寺本孝行; 徳永旭将; 広瀬修; Stephen Wu; 豊島有; ジャン ムンソン; 吉田亮; 飯野雄一; 石原健
第56回日本生物物理学会年会, 15 Sep. 2018, 日本生物物理学

線虫の全中枢神経細胞活動データに対する因果性解析II　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史; 佐藤博文; 大江紗; 久下小百合; 寺本孝行; 徳永旭将; 広瀬修; Stephen Wu; 豊島有; ジャン ムンソン; 吉田亮; 飯野雄一; 石原健
日本物理学会 2018年秋季大会, 11 Sep. 2018, 日本物理学会

Robustness analysis on synaptic structure and causality analysis on whole-brain imaging data　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki; Hirofumi Sato; Suzu Oe; Sayuri Kuge; Takayuki Teramoto; Terumasa Tokunaga; Osamu Hirose; Stephen Wu; Yu Toyoshima; Moon Sun Jang; Ryo Yoshida; Yuichi Iino; Takeshi Ishihara
CeNeuro 2018 (C.elegans Topic Meeting: Neuronal Development, Synaptic Function and Behavior), 27 Jun. 2018

Neuronal signaling pathways estimated from whole-brain imaging data of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Y. Iwasaki; T. Teramoto; S. Oe; T. Tokunaga; O. Hirose; S. Wu; Y. Toyoshima; M.-S. Jang; R. Yoshida; Y. Iino; T. Ishihara
19th IUPAB Congress and 11th EBSA Congress, 18 Jul. 2017

Mathematical methods to analyze imaging data in the whole central nervous system: From noise reduction to causality detection　　　　　　　　　　　　　　　
Y. Iwasaki; T. Teramoto; S. Oe; T. Tokunaga; O. Hirose; S. Wu; Y. Toyoshima; M. S. Jang; R. Yoshida; Y. Iino; T. Ishihara
21th International C. elegans Conference, 24 Jun. 2017

線虫の全脳活動データに対する位相解析　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史; 寺本孝行; 大江紗; 徳永旭将; 広瀬修; Stephen Wu; 豊島有; ジャン ムンソン; 吉田亮; 飯野雄一; 石原健
日本物理学 第72回年次大会, 17 Mar. 2017

Large Graph Laplacian Matrix and Functional Map of Whole Brain of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Hiromu Sakuma; Takayuki Teramoto; Sayuri Kuge; Takeshi Ishihara; Yuishi Iwasaki
The 2016 International Symposium on Nonlinear Theory and Its Applications, 30 Nov. 2016

Phase synchronization analysis of whole-brain imaging data of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki; Takayuki Teramoto; Terumasa Tokunaga; Osamu Hirose; Yu Toyoshima; Ryo Yoshida; Yuichi Iino; Takeshi Ishihara
第54回日本生物物理学会大会, 27 Nov. 2016

Collective dynamics in whole-brain of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki; Takayuki Teramoto; Ryo Yoshida; Yuichi Iino; Takeshi Ishihara
The 17th International Conference on Systems Biology, 17 Sep. 2016

Correlation clustering reveals intrinsic graph structure of whole-brain imaging data　　　　　　　　　　　　　　　
Hiromu Sakuma; Takayuki Teramoto; Terumasa Tokunaga; Osamu Hirose; Yu Toyoshima; Yuichi Iino; Ryo Yoshida; Takeshi Ishihara; Yuishi Iwasaki
C. elegans Topic Meeting: Neuronal Development, Synaptic Function and Behavior, 29 Jul. 2016

Directed graph of whole-brain imaging recordings: neural signaling and phase synchronization　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki; Hiromu Sakuma; Takayuki Teramoto; Sayuri Kuge; Ryo Yoshida; Yuichi Iino; Takeshi Ishihara
The 7th Asia-Pacific C. elegans Meeting, 28 Jun. 2016

Intrinsic graph structure estimation from whole-brain imaging data of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Hiromu Sakuma; Takayuki Teramoto; Sayuri Kuge; Terumasa Tokunaga; Osamu Hirose; Yu Toyoshima; Yuichi Iino; Ryo Yoshida; Takeshi Ishihara; Yuishi Iwasaki
16th International Conference on Systems Biology, 23 Nov. 2015

Ca2+ dependent negative feedback loop in AWC olfactory neurons: from mathematical viewpoint　　　　　　　　　　　　　　　
M. Usuyama; S. Kuge; T. Teramoto; T. Ishihara; Y. Iwasaki
20th International C. elegans Conference, 26 Jun. 2015

Spatial-temporal Ca2+ dynamics in a whole single neuron of C. elegans: Mathematical modeling and analysis　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史; 久下小百合; 寺本孝行; 石原健
第52回日本生物物理学会年会, 26 Sep. 2014
20140925, 20140927

A computational model of olfactory signaling in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Mamoru Usuyama; Yuishi Iwasaki
C. elegans Development, Cell Biology, and Gene Expression Topic Meeting & 6th Asia-Pacific C. elegans Meeting, 17 Jul. 2014

Numerical approach towards quantitative understanding of neural network of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Takuya Onuma; Hirofumi Sato; Yuichi Iino; Yuishi Iwasaki
C. elegans Development, Cell Biology, and Gene Expression Topic Meeting & 6th Asia-Pacific C. elegans Meeting, 16 Jul. 2014

Electrodiffusion model for Ca2+ dynamics of a whole single neuron　　　　　　　　　　　　　　　
Y. Iwasaki; S. Kuge; T. Teramoto; T. Ishihara
CeNeuro 2014, 08 Jul. 2014

A computational model of the intracellular signaling pathway for odor receptor neuron in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
M. Usuyama; Y. Iwasaki; C. Ushida; R. Shingai
19th International C. elegans Conference, 28 Jun. 2013

A neuronal mechanism for navigation along a repulsive odor gradient　　　　　　　　　　　　　　　
A. Yamazoe; Y. Tanimoto; K. Fujita; Y. Kawazoe; Y. Miyanishi; S. J. Yamazaki; X. Fei; K. E. Busch; K. Gengyo-Ando; J. Nakai; Y. Iino; Y. Iwasaki; K. Hashimoto; K. Kimura
19th International C. elegans Conference, 27 Jun. 2013

Computational evaluation of odor gradient in chemotaxis assay　　　　　　　　　　　　　　　
Y. Iwasaki; H. Ichijo; R. Shingai; A. Yamazoe; K. Kimura
5th East Asia C. elegans Meeting, 27 Jun. 2012

線虫のニューロンと蛍光Ca2+インジケータに関する動的モデル　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史
新学術領域「システム分子行動学」数理シンポジウム, 11 May 2012, [Invited]

Neural circuit model for head swing and forward/backward movement of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
R. Shingai; H. Takahashi; Y. Iwasaki
Neuroscience 2011, 12 Nov. 2011

Neuronal modeling toward quantitative understanding of nervous system of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Y. Iwasaki; M. Kuramochi; K. Sakata; S. Oda; Y. Iino and R. Shingai
18th International C. elegans Conference, 22 Jun. 2011

Worms maintain their response to a repulsive odor 2-nonanone during avoidance behavior　　　　　　　　　　　　　　　
Akiko Yamazoe; Yuishi Iwasaki; Kotaro Kimura
18th International C. elegans Conference, 22 Jun. 2011

Dynamical model variables, calcium imaging and design of C. elegans neuron　　　　　　　　　　　　　　　
M. Kuramochi; K. Sakata; R. Shingai and Y. Iwasaki
7th Asian Biophysics Association Symposium, 30 Jan. 2011

Quantitative Modeling of Neuronal Dynamics in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
M. Kuramochi and Y. Iwasaki
17th International Conference on Neural Information Processing, 22 Nov. 2010

Neuronal model including Ca²⁺ dynamics in C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
M. Kuramochi; K. Sakata; R. Shingai and Y. Iwasaki
4th East Asia C. elegans Meeting, 12 Jul. 2010

Analysis of noise robustness in neural circuit of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Y. Iwasaki
the 17th International C. elegans Conference, 27 Jun. 2009, The Genetics of America Conferences

Numerical study of habituation to touch stimulation and synaptic plasticity　　　　　　　　　　　　　　　
Y. Iwasaki
the 16th International C. elegans Conference, 28 Jun. 2007, The Genetics Society of America Conferences

線虫の行動学習とシナプス可塑性　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎 唯史
日本物理学会2007年春季大会, 21 Mar. 2007, 日本物理学会

Neural Circuit and Behavioral Criteria of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki
Fifth East Asian Biophysics Symposium, 14 Nov. 2006, 日本生物物理学会

部分神経回路に対する動的平均場理論　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎唯史
日本物理学第61回年次大会, 29 Mar. 2006

How to model and study a partial neural circuit of C. elegans?　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki
Abstract of the 15th International C. elegans Conference, 26 Jun. 2005

Anatomical Data of Synaptic Connectivity of C. elegans are Almost Perfectly Self-contained　　　　　　　　　　　　　　　
Kiyoshi Kawamura; Ken-ichi Oshio; Yuishi Iwasaki; Satoru Morita; Yuko Osana; Sohei Gomi; Kazumi Omata; Eizo Akiyama
2004 East Asia Worm Meeting, 29 Jun. 2004

C. elegansの新しい神経回路データベース　　　　　　　　　　　　　　　
生塩 研一; 岩崎 唯史; 守田 智; 長名 優子; 五味 壮平; 秋山 英三; 尾又 一実; 岡 浩太郎; 川村 清
日本物理学会 第59回年次大会, 29 Mar. 2004

Statistical formulations for a partial neural circuit of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki; Sohei Gomi
14th International C. elegans Conference, 02 Jul. 2003

Neuronal Circuit and Native Responses of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Kiyoshi Kawamura; Yasuhiro Funabashi; Ken-ichi Oshio; Satoru Morita; Yuko Osana; Yuishi Iwasaki; Sohei Gomi; Kazumi Omata; Eizo Akiyama; Kotaro Oka
14th International C. elegans Conference, 02 Jul. 2003

線虫の部分神経回路網に対する統計的解析手法　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎 唯史; 五味 壮平
日本物理学 第58回年次大会, 28 Mar. 2003

線虫の部分神経回路網に関する統計的解析手法：シナプス結合の符号予測への応用　　　　　　　　　　　　　　　
岩崎 唯史; 五味 壮平
日本生物物理学会第39回年会, 04 Oct. 2002

Revision of synaptic connectivity database　　　　　　　　　　　　　　　
Ken-ichi Oshio; Satoru Morita; Yuko Osana; Yuishi Iwasaki; Sohei Gomi; Kazumi Omata; Eizo Akiyama; Kotaro Oka
3rd Japanese C. elegans meeting, 06 Aug. 2002

Stochastic method to predict synaptic signs in a partial neural network of C. elegans　　　　　　　　　　　　　　　
Yuishi Iwasaki; Sohei Gomi
3rd Japanese C. elegans meeting, 06 Aug. 2002

Numerical Study on Excitatory and Inhibitory Pathways in Neural Network of C. elegans(共著)　　　　　　　　　　　　　　　
Y. Iwasaki; S. Gomi; Y. Osana; K. Oshio; S. Morita and K. Oka
Proceedings of Third East Asian Biophysics Symposium, May 2000

Apr. 2024 - Present
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