Nov. 2021, Selection Committee Special Award 2020, Aposymbiosis of a Burkholderiaceae-related endobacterium impacts on sexual reproduction of its fungal host, Microbes and Environments
Yusuke Takashima;Yousuke Degawa;Tomoyasu Nishizawa;Hiroyuki Ohta, Kazuhiko Narisawa

Aug. 2021, MSJ (The Mycological Society of Japan) Young Investigator Award, Studies on relationships between Mortierella spp. and its bacterial endosymbionts, The Mycological Society of Japan
Yusuke Takashima

Sep. 2016, 学生優秀発表賞, Mortierella parvisporaに内生するMycoavidus属細菌による宿主の接合胞子形成の阻害, 日本菌学会第60回大会
高島勇介;太田寛行;成澤才彦

Sep. 2013, Best Presenter Award, The occurrence of unique morphologies of arbuscular mycorrhizal fungi associated with Huperzia spp. in Mt. Pangrango, West Java, Indonesia, International Symposium on Tropical Fungi 2013
Yusuke Takashima;Kazuhiko Narisawa;Iman Hidayat;Gayuh Rahayu

Mar. 2012, 第5回学生サステイナビリティフォーラム優秀ポスター賞, カビの中にもバクテリアが棲んでいる ー接合菌に内生するバクテリアについてー, 茨城大学ICAS
高島勇介

Cladophialophora novalis sp. nov.: A dark septate endophytic fungus derived from fallow land soil
Felix, Fitra Parlindo; Mana Noguchi; Ni Luh; Putu Citra Innosensia; Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa
Mycobiology, 02 Nov. 2025, [Reviewed]

Complete genome sequences of Pseudomonas allii, pathogens causing bacterial rot on onion, tomato, Chinese yam, and lettuce in Japan
Takashima, Y.; Naito, K.; Satou, M.; Sawada, H., Lead
Microbiology Resource Announcements, 08 May 2025, [Reviewed]

Complete genome sequences of tolaasin-detoxifying Mycetocola species isolated from oyster mushroom
Yusuke Takashima; Ken Naito; Mamoru Satou, Lead
Access Microbiology (Preprint), Apr. 2025

Afipia dichlorophenoxyacetatis sp. nov., isolated from field soil in Japan, degrades 2,4-dichlorophenoxyacetic acid
Hiroyuki Sawada; Yoriko Sakai; Yusuke Takashima; Ken Naito; Mitsuo Horita; Mamoru Satou, Bacterial strains, designated DD3^T and DDX28, were isolated from field soil in Japan. The strains had the ability to use 2,4-dichlorophenoxyacetic acid as the sole carbon source. They were Gram-reaction-negative, oxidase-positive, weakly catalase-positive, aerobic and non-spore-forming. Their cells were rod-shaped and often lacked flagella, but some exhibited motility due to the presence of one or two polar flagella. The genomic DNA G+C content was 58.8 mol%, and the major cellular fatty acids (>10% of the total fatty acids) were summed feature 8 (C_18 : 1  ω7c and/or C_18 : 1  ω6c), C_18 : 0 and C_17 : 0 cyclo. Phylogenetic analyses based on gyrB gene sequences and phylogenomic analysis using whole-genome sequences confirmed that the strains belong to the genus Afipia; however, their phylogenetic position did not match that of any known species of this genus. Comparative studies of the average nucleotide identity and digital DNA–DNA hybridization with closely related species revealed values lower than the thresholds used for prokaryotic species delineation (95–96 and 70%, respectively), with the highest values observed for Afipia broomeae ATCC 49717^T (79.92 and 21.5%, respectively). Phenotypic characteristics, cellular fatty acid composition and specific metabolic processes and biosynthetic gene clusters could differentiate the strains from their closest relatives. Our phenotypic, chemotaxonomic and genotypic data indicate that DD3^T/DDX28 constitute a novel Afipia species, for which we propose the name Afipia dichlorophenoxyacetatis sp. nov., with DD3^T (MAFF 311804^T=ICMP 25015^T) as the type strain., Microbiology Society
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 10 Feb. 2025, [Reviewed]

Acidovorax sacchari sp. nov., a pathogen causing red stripe of sugarcane in Japan
Hiroyuki Sawada; Hirosuke Shinohara; Yusuke Takashima; Ken Naito; Mamoru Satou, Phytopathogenic bacteria (MAFF 311311^T and MAFF 311313) were isolated from sugarcane plants exhibiting leaf stripe symptoms associated with red stripe disease in Okinawa Prefecture, Japan. The strains were Gram-reaction-negative, aerobic, motile with one polar flagellum, rod-shaped and non-spore-forming. The genomic DNA G+C content was 69.0 mol%, and the major cellular fatty acids (>10 % of the total fatty acids) included summed feature 3 (C_16 : 1  ω7c and/or C_16 : 1  ω6c), C_16 : 0 and summed feature 8 (C_18 : 1  ω7c and/or C_18 : 1  ω6c). Phylogenomic analyses using whole-genome sequences consistently placed these strains within the genus Acidovorax. However, their phylogenetic positions did not correspond to any known species within this genus. Comparative analyses, including average nucleotide identity and digital DNA–DNA hybridization with closely related species, yielded values below the thresholds for prokaryotic species delineation (95–96 and 70 %, respectively), with the highest values observed for Acidovorax oryzae ATCC 19882^T (93.98 and 54.3 %, respectively). Phenotypic characteristics, cellular fatty acid composition and a repertoire of secretion systems and their effectors can differentiate these strains from their closest relatives. The phenotypic, chemotaxonomic and genotypic data obtained in this study indicate that MAFF 311311^T and MAFF 311313 constitute a novel species within the genus Acidovorax, for which we propose the name Acidovorax sacchari sp. nov., with MAFF 311311^T (=ICMP 25276^T) designated as the type strain., Microbiology Society
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 05 Feb. 2025, [Reviewed]

Live imaging analysis of sexual and asexual reproduction, zygospore and sporangiospore formation, in Gilbertella persicaria
Norio Takeshita; Yusuke Takashima; Yousuke Degawa, The Mycological Society of Japan
Mycoscience, 05 Jun. 2024, [Reviewed]

Detection and isolation of a new member of Burkholderiaceae-related endofungal bacteria from Saksenaea boninensis sp. nov., a new thermotolerant fungus in Mucorales
Yusuke Takashima; Kohei Yamamoto; Yousuke Degawa; Yong Guo; Tomoyasu Nishizawa; Hiroyuki Ohta; Kazuhiko Narisawa, Lead, Abstract

Thermotolerance in Mucorales (Mucoromycotina) is one of the factors to be opportunistic pathogens, causing mucormycosis. Among thermotolerant mucoralean fungi, Burkholderiaceae-related endobacteria (BRE) are rarely found and the known range of hosts is limited to Rhizopus spp. The phylogenetic divergence of BRE has recently expanded in other fungal groups such as Mortierellaceae spp. (Mortierellomycotina); however, it remains unexplored in Mucorales. Here, we found a thermotolerant mucoralean fungus obtained from a litter sample collected from Haha-jima Island in the Ogasawara (Bonin) Islands, Japan. The fungus was morphologically, phylogenetically, and physiologically characterized and proposed as a new species, Saksenaea boninensis sp. nov. Besides the fungal taxonomy, we also found the presence of BRE in isolates of this species by diagnostic PCR amplification of the 16S rRNA gene from mycelia, fluorescence microscopic observations, and isolation of the bacterium in pure culture. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene of BRE revealed that it is distinct from all known BRE. The discovery of a culturable BRE lineage in the genus Saksenaea will add new insight into the evolutional origin of mucoralean fungus-BRE associations and emphasize the need to pay more attention to endofungal bacteria potentially associated with isolates of thermotolerant mucoralean fungi causing mucormycosis., Springer Science and Business Media LLC
IMA Fungus, 23 Nov. 2023, [Reviewed]

A new genus Unguispora in Kickxellales shows an intermediate lifestyle between saprobic and gut-inhabiting fungi
Tomohiko Ri; Mai Suyama; Yusuke Takashima; Kensuke Seto; Yousuke Degawa, Informa UK Limited
Mycologia, 27 Sep. 2022, [Reviewed]

Revisiting the isolation source after the first discovery: Myconymphaea yatsukahoi on excrements of Lithobiomorpha (Chilopoda)
Yusuke Takashima; Mai Suyama; Kohei Yamamoto; Tomohiko Ri; Kazuhiko Narisawa; Yousuke Degawa, Lead, The Mycological Society of Japan
Mycoscience, 31 Jul. 2022, [Reviewed]

Biocontrol of Pythium root rot on lisianthus using a new dark septate endophytic fungus Hyaloscypha variabilis J1PC1
Malek Marian; Yusuke Takashima; Wiwiek Harsonowati; Haruhiko Murota; Kazuhiko Narisawa, Springer Science and Business Media LLC
European Journal of Plant Pathology, 07 Feb. 2022, [Reviewed]

Whole-Genome Sequence of Entomortierella parvispora E1425, a Mucoromycotan Fungus Associated with Burkholderiaceae-Related Endosymbiotic Bacteria
Afri Herlambang; Yong Guo; Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa; Hiroyuki Ohta; Tomoyasu Nishizawa, Some mucoromycotan fungi establish symbiotic associations with endohyphal bacteria. Here, the genome of Entomortierella parvispora E1425 (synonymously known as Mortierella parvispora E1425), which harbors a cultured Burkholderiaceae -related endobacterium (BRE) designated Mycoavidus sp. Strain B2-EB, was sequenced. We provide genomic information to elucidate fungal-BRE symbiotic features., American Society for Microbiology
Microbiology Resource Announcements, 20 Jan. 2022, [Reviewed]

Characteristics of Cenococcum geophilum sclerotia found in steppe forest soil in Mongolia
Khulan Nyamsanjaa; Bolormaa Oyuntsetseg; Yusuke Takashima; Nobuo Sakagami; Makiko Watanabe, Informa UK Limited
Journal of Forest Research, 02 Dec. 2021, [Reviewed]

Revisiting the isolation source after half a century: Emericellopsis mirabilis on a yellow-green alga
Yusuke Takashima; Takeshi Nakayama; Yousuke Degawa, Lead
Mycoscience, 20 Jul. 2021, [Reviewed]

The Enigmatic Snow Microorganism, Chionaster nivalis, Is Closely Related to Bartheletia paradoxa (Agaricomycotina, Basidiomycota)
Ryo Matsuzaki; Yusuke Takashima; Iwane Suzuki; Masanobu Kawachi; Hisayoshi Nozaki; Seiichi Nohara; Yousuke Degawa, Chionaster nivalis is frequently detected in thawing snowpacks and glaciers. However, the taxonomic position of this species above the genus level remains unclear. We herein conducted molecular analyses of C. nivalis using the ribosomal RNA operon sequences obtained from more than 200 cells of this species isolated from a field-collected material. Our molecular phylogenetic analyses revealed that C. nivalis is a sister to Bartheletia paradoxa, which is an orphan basal lineage of Agaricomycotina. We also showed that C. nivalis sequences were contained in several previously examined meta-amplicon sequence datasets from snowpacks and glaciers in the Northern Hemisphere and Antarctica., Japanese Society of Microbial Ecology
Microbes and Environments, 16 Jun. 2021, [Reviewed]

糸状菌に内生する細菌の縮小化ゲノムの特徴　　　　　　　　　　　　　　　
郭永; 高島勇介; 西澤智康
バイオサイエンスとインダストリー（B＆I）, Mar. 2021, [Invited]

Mycoavidus sp. Strain B2-EB: Comparative Genomics Reveals Minimal Genomic Features Required by a Cultivable Burkholderiaceae-Related Endofungal Bacterium
Yong Guo; Yusuke Takashima; Yoshinori Sato; Kazuhiko Narisawa; Hiroyuki Ohta; Tomoyasu Nishizawa, Lead, This study attempted the isolation of a novel endobacterium,
Mycoavidus
sp. B2-EB (JCM 33615), harbored in the fungal host
Mortierella parvispora
E1425 (JCM 39028). We report the complete genome sequence of this strain, which possesses a reduced genome size with relatively high genome completeness and a streamlined genome structure. The information indicates the minimal genomic features required by both the endofungal lifestyle and artificial cultivation, which furthers our understanding of genome reduction in fungal endosymbionts and extends the culture resources for biotechnological development on engineering synthetic microbiomes., American Society for Microbiology
Applied and Environmental Microbiology, Sep. 2020, [Reviewed]

Aposymbiosis of a Burkholderiaceae-related endobacterium impacts on sexual reproduction of its fungal host　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Yousuke Degawa; Tomoyasu Nishizawa; Hiroyuki Ohta; Kazuhiko Narisawa, Lead
Microbes and environments, Apr. 2020, [Reviewed]

Mortierella oedorhiza, a new species forming a dichotomously branched rhizoid at the sporangiophore base　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Yousuke Degawa; Kazuhiko Narisawa
Mycoscience, Nov. 2019, [Reviewed]

A sporocarpic species of Glomeromycotina, Glomus radiatum new to Japan
Kohei Yamamoto; Yusuke Takashima; Mai Suyama; Teruhisa Masaki; Yousuke Degawa
Truffology, Mar. 2019, [Reviewed]

Prevalence and intra-family phylogenetic divergence of Burkholderiaceae-related endobacteria associated with species of Mortierella
Yusuke Takashima; Kensuke Seto; Yousuke Degawa; Yong Guo; Tomoyasu Nishizawa; Hiroyuki Ohta; Kazuhiko Narisawa, Japanese Society of Microbial Ecology
Microbes and environments, Dec. 2018, [Reviewed]

Soil environmental condition and vegetation recovery of the abandoned cropland around Komado-shitsugen moor, Fukushima prefecture　　　　　　　　　　　　　　　
Nobuo Sakagami; Yong Guo; Yusuke Takashima; Tomoyasu Nishizawa; Kazuhiko Narisawa; Makiko Watanabe
17th World Lake Conference, Lake Kasumigaura, Oct. 2018

Mortierella sugadairana, a new homothallic species related to the firstly described heterothallic species in the genus
Yusuke Takashima; Yousuke Degawa; Hiroyuki Ohta; Kazuhiko Narisawa, Lead, Elsevier B.V.
Mycoscience, 01 May 2018, [Reviewed]

Comparative Genomic Insights into Endofungal Lifestyles of Two Bacterial Endosymbionts, Mycoavidus cysteinexigens and Burkholderia rhizoxinica
Dilruba Sharmin; Yong Guo; Tomoyasu Nishizawa; Shoko Ohshima; Yoshinori Sato; Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa; Hiroyuki Ohta, Japanese Society of Microbial Ecology
Microbes and Environments, 2018, [Reviewed]

Endogone corticioides sp nov from subalpine conifer forests in Japan and China, and its multi-locus phylogeny
Kohei Yamamoto; Yousuke Degawa; Yusuke Takashima; Masaki Fukuda; Akiyoshi Yamada
Mycoscience, Jan. 2017, [Reviewed]

Cladophialophora inabaensis sp nov., a New Species among the Dark Septate Endophytes from a Secondary Forest in Tottori, Japan
Erika Usui; Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa
Microbes and Environments, Sep. 2016, [Reviewed]

Mycoavidus cysteinexigens gen. nov., sp nov., an endohyphal bacterium isolated from a soil isolate of the fungus Mortierella elongata
Shoko Ohshima; Yoshinori Sato; Reiko Fujimura; Yusuke Takashima; Moriyuki Hamada; Tomoyasu Nishizawa; Kazuhiko Narisawa; Hiroyuki Ohta
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, May 2016, [Reviewed]

Symbiotic world dominated by soil microorganisms: introduction to the advanced research on symbiosis and their applications to agriculture. 4. Ecology and function ofendohyphal bacteria
OHTA Hiroyuki; NISHIZAWA Tomoyasu; MASTUOKA Yuto; TAKASHIMA Yusuke; NARISAWA Kazuhiko, Japanese Society of Soil Science and Plant Nutrition
Japanese Journal of Soil Science and Plant Nutrition, 2016, [Reviewed]

Do the endofungal bacteria control the nature of fungal endophytes?
Takashima Yusuke; Ohta Hiroyuki; Narisawa Kazuhiko, 生物間における共生的結びつきは，多くの生物群で見出され，互いの生物の生存・繁殖に不可欠なものとなっている。糸状菌類では，菌根菌に代表されるように，植物との共生関係はよく知られている。近年，菌類に内生する細菌類の存在が明らかになってきており，現在では，3門4亜門7綱21目36科41属約73種148系統の菌類より菌類内生細菌が報告されており，今後も増え続けることが予想される。また，菌類単独の能力と思われていた諸形質を細菌がコントロールしているという知見も報告されている。エンドファイトなどの共生菌類にも内生する細菌の存在が報告され，植物－エンドファイト－内生細菌を1つの複合系としてとらえ，その相互作用や生態を明らかにする必要が生じている。, the Japanese Society of Soil Microbiology
土と微生物, 2015, [Reviewed]

First report on fungal symbionts of Lycopodiaceae root from Mount Gede Pangrango National Park Indonesia
Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa; Iman Hidayat; Gayuh Rahayu, Association of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) with plant roots is often stated as critical to the successful establishment and diversification of terrestial plants. Information on AMF associations with Lycopodiaceae, ancient lineages of terrestrial plants, contributes to the understanding of terrestrial colonization of plants. While diversity of AMF and other fungal endophytes of some agricultural plants in Indonesia is extensively studied, terresterial Lycopodiaceae are not well documented. In this study, colonization status of AMF and root endophytic fungi (REF) in sporophytes of terresterial Lycopodiaceae (Huperzia selago, H. serrata and Lycopodium clavatum) inhabiting Mt. Pangrango at different altitudes were investigated on the basis of root microscopic observations and culture-dependent methods, respectively. As results, AMF colonization was observed in H. selago collected from near summit (NS, 2998 m asl) and H. serrata collected from Kandang Badak (KB, 2440 m asl) and Cibereum Water Fall (CF, 1728 m asl), but not in L. clavatum from Mount Pangrango Summit (PS, 3019 m asl). These results indicate that the colonization rate of AMF is affected by differences in altitude. REF isolates consisting of seven genera including Cadophora, Cladophialophora, Cryptosporiopsis, Leohumicola, Leptodontidium, Phialocephala, Pseudoclathrosphaerina (putatively similar to Meliniomyces), and ecologically uncertain Helotiales were obtained. These isolates contained putative dark septate endophytes (DSE) and ericoid mycorrhiza and were more diverse around sub-alpine areas (NS, KB and PS sites) than in motane areas (CF site). The presence of these REF may be affected by a complex and mixed plant vegetation in the transition zone between the montane and sub-alpine areas., Agricultural and Forestry Research Center, University of Tsukuba
Journal of Developments in Sustainable Agriculture, 2014, [Reviewed]

12th International Mycological Congress (IMC12)参加報告　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima
日本微生物資源学会誌, Dec. 2024
Lead

フウセンモのハリセンボン
高島勇介
菅平生き物通信, Dec. 2020
Lead

微生物研究の原点にして頂点、純粋培養
高島勇介
菅平生き物通信, Oct. 2019
Lead

学位論文要旨　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介
日本菌学会ニュースレター, Jul. 2019
Lead

Elucidation of Biological Interactions of Endohyphal Bacteria within Fungal Hyphae
西澤智康; 郭永(共同研究者); 高島勇介(共同研究者); 成澤才彦(共同研究者); 太田寬行(共同研究者)
IFO Research Communications, 2019

カビを操る内生細菌 -菌類に内生する細菌が宿主をコントロールする?
松下紗季; 高島勇介; 成澤才彦
SATテクノロジー・ショーケース2018, 08 Feb. 2018

糸状菌に内生するMycoavidus属細菌のゲノム収縮過程
郭永; 高島勇介; 成澤才彦; 太田寛行; 西澤智康
SATテクノロジー・ショーケース2018, 08 Feb. 2018

Rhizopodopsis javensis Boedijnの再発見　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介
日本菌学会ニュースレター, Jan. 2016
Lead

環境微生物系学会合同大会2014に参加して　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介
日本菌学会ニュースレター, Jan. 2015
Lead

Microbial Environmental Genomics (MEG), Methods in Molecular Biology　　　　　　　　　　　　　　　
Alessandro Desirò; Yusuke Takashima; Gregory Bonito; Tomoyasu Nishizawa; Kazuhiko Narisawa; Paola Bonfante, Contributor
Humana, 16 Dec. 2022
9781071628706

〔Major achievements〕Lack of transporters is putative entry point for nutritional dependency of endohyphal bacteria　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Ken Naito; Kazuhiko Narisawa
MSJ-MSA Joint Symposium, MSJ international symposium day, 16 May 2025, [Invited]

‘Database of Plant Diseases in Japan’ in the Genebank project　　　　　　　　　　　　　　　
Mamoru Satou; Tamaki Uehara-Ichiki; Shihomi Uzuhashi; Yusuke Takashima; Fukuhiro Yamasaki
The 5th Korea-Japan Joint Symposium on Plant Pathology, Mar. 2025
20250324, 20250326

〔Major achievements〕細菌の“Complete genome”を比較する －糸状菌に細胞内共生するMycetohabitans属細菌を例として－　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 内藤健
第37回日本微生物生態学会大会, 29 Oct. 2024
20241028, 20241031

〔Major achievements〕Comparative genomics and phylogenomic investigation of a new member of Burkholderiaceae-related endobacteria isolated from Saksenaea boninensis　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Hiroyuki Sawada; Kohei Yamamoto; Yousuke Degawa; Yong Guo; Tomoyasu Nishizawa; Hiroyuki Ohta; Kazuhiko Narisawa
12th International Mycological Congress (IMC12), 14 Aug. 2024
20240811, 20240815

農業生物資源ジーンバンク事業のうち微生物遺伝資源（NARO-MAFF）における2023年度の活動と成果　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 遠野雅徳; 一木(植原)珠樹; 山﨑福容; 月居佳史; 鬼頭英樹; 澤田宏之; 青木孝之; 永井利郎; 佐藤 衛; 杉浦 誠
日本微生物資源学会第 30 回大会, 04 Jul. 2024
20240703, 20240705

茅葺屋根に生息するRhizopus属菌の分布と生態　　　　　　　　　　　　　　　
大橋美紗希; 高島勇介; 廣田充; 阿部淳一ピーター; 出川洋介
日本菌学会 第 67 回大会, May 2023
20230527, 20230528

〔Major achievements〕Mortierella sugadairana に細胞内共生するBurkholderiaceae未記載種のゲノム解析　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 郭永; 吉橋佑馬; 出川洋介; 西澤智康; 成澤才彦; 津田吉晃
日本微生物生態学会第35回大会, Oct. 2022

高温性ケカビ目菌類を宿主とする細胞内共生細菌の検出および分離培養
高島勇介; 大橋美紗希; 出川洋介; 廣田充; 阿部淳一ピーター; 萩原大祐; 矢口貴志
日本菌学会第 66 回大会, Aug. 2022
20220820, 20220828

〔Major achievements〕Studies on relationships between Mortierella spp. and its bacterial endosymbionts　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima
日本菌学会第65回大会, 28 Aug. 2021, [Invited]
20210823, 20210829

〔Major achievements〕Genome assembly practices for fungi-bacteria consortia using simple and complex metagenomic data　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Kohei Yamamoto
日本菌学会第65回大会, 25 Aug. 2021
20210823, 20210829

野外採集，標本記録および私信史料から把握された日本産Sorosphaerula veronicaeの分布範囲
高島勇介; 橋本陽; 升本宙; 大熊盛也; 出川洋介
日本菌学会第 65 回大会, Aug. 2021
20210823, 20210829

雪氷微生物Chionaster nivalisは生きる化石Bartheletia paradoxaに近縁だった　　　　　　　　　　　　　　　
松﨑令; 高島勇介; 鈴木石根; 河地正伸; 野崎久義; 野原精一; 出川洋介
日本菌学会第 65 回大会, Aug. 2021

MOLECULAR ANALYSES FOR THE SNOW-INHABITING MICROORGANISM, CHIONASTER NIVALIS　　　　　　　　　　　　　　　
Ryo Matsuzaki; Yusuke Takashima; Iwane Suzuki; Masanobu Kawachi; Hisayoshi Nozaki; Seiichi Nohara; Yousuke Degawa
75th Annual Meeting of the Phycological Society of America, Jul. 2021
20210713, 20210722

駒止湿原開墾跡地でのブナ林再生に向けた植樹試験における共生菌類の利用　　　　　　　　　　　　　　　
轟丈瑠,郭永,西澤智康,高島勇介,渡邊眞紀子,成澤才彦,坂上伸生
日本土壌微生物学会2021年度大会, Jun. 2021

分子データに基づく雪氷微生物Chionaster nivalisの系統上の位置と分布　　　　　　　　　　　　　　　
松﨑令; 高島勇介; 鈴木石根; 河地正伸; 野崎久義; 野原精一; 出川洋介
日本微生物資源学会第27回大会, Jun. 2021

雪氷微生物Chionaster nivalisの分子系統解析　　　　　　　　　　　　　　　
松﨑令; 高島勇介; 鈴木石根; 河地正伸; 野崎久義; 野原精一; 出川洋介
日本植物分類学会第21回大会, Mar. 2021

フウセンモ寄生菌Emericellopsis mirabilisは宿主の不動胞子を伸長させる　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 中山剛; 出川洋介
第6回山岳科学学術集会, Dec. 2020
20201212, 20201213

菅平高原とその周辺に発生した菌寄生菌について　　　　　　　　　　　　　　　
前川直人; 高島勇介; 出川洋介
第6回山岳科学学術集会, Dec. 2020

陸生藻類と菌類の相互関係の探索：フウセンモに発生した糸状菌について　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 中山剛; 出川洋介
Symbio2020 日本共生生物学会第4回大会, 31 Oct. 2020
20201031, 20201101

駒止湿原開墾跡地におけるブナ共生菌類を利用した植樹試験の試行　　　　　　　　　　　　　　　
轟丈瑠; 郭永; 高島勇介; 渡邊眞紀子; 西澤智康; 成澤才彦; 坂上伸生
日本土壌微生物学会2020年度大会, Jun. 2020

分類学的所属不明の菌寄生菌Nothadelphia属の未記載種について　　　　　　　　　　　　　　　
出川洋介; 高島勇介; 稲葉重樹
日本菌学会第64回大会, Jun. 2020

Myconymphaea属菌の発生基質の特定および1未記載種の発見　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 渡辺舞; 出川洋介
日本菌学会第64回大会, Jun. 2020

玉原高原におけるイシムカデ糞生菌Myconymphaea属菌の探索
高島勇介; 出川洋介
2019年度ぐんまの自然の「いま」を伝える報告会, 11 Jan. 2020

Myconymphaea yatsukahoiはイシムカデ目の糞生菌である　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 出川洋介
第5回山岳科学学術集会, Dec. 2019
20191214, 20191215

カビの中に棲むバクテリアは何をしている？‐菌類内生菌バクテリアの多様性および宿主有性植物との関係‐　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介
第59会プロチスタフォーラム, 09 Dec. 2019

〔Major achievements〕Aposymbiosis of an endofungal bacterium impacts on sexual reproduction of its fungal host　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Yong Guo; Yousuke Degawa; Tomoyasu Nishizawa; Hiroyuki Ohta; Kazuhiko Narisawa
Asian Mycological Congress 2019, 04 Oct. 2019

Rediscovery of Rhizopodopsis javensis, monotypic genus of Indonesian Mucorales with taxonomically ambiguous status　　　　　　　　　　　　　　　
Gayuh Rahayu; Rudy Hermawan; Iman Hidayat; Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa; Yousuke Degawa
Asian Mycological Congress 2019, 01 Oct. 2019

Mortierella humilis/ verticillata complexとその内生細菌のトマト生育への影響について　　　　　　　　　　　　　　　
松下紗季; 高島勇介; 西澤智康; 太田寛行; 成澤才彦
日本微生物生態学会第33回大会, 11 Sep. 2019

Comparative genomics highlights extreme genome reduction in a newly-cultured Mycoavidus-related endofungal bacterium dwelling in Mortierella parvispora　　　　　　　　　　　　　　　
Yong Guo; Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa; Hiroyuki Ohta; Tomoyasu Nishizawa
ASM Microbes 2019, 21 Jun. 2019

Mortierella属糸状菌に内生するMycoavidus属細菌のゲノム縮小化　　　　　　　　　　　　　　　
郭永; 高島勇介; Dilruba Sharmin; 佐藤嘉則; 成澤才彦; 太田寛行; 西澤智康
日本土壌微生物学会2019年度大会, 15 Jun. 2019

Comparative metagenomic insights into functional diversification of soil microbiome across a vegetation gradient on the deforested land around Komado wetland　　　　　　　　　　　　　　　
Yong Guo; Yusuke Takashima; Nobuo Sakagami; Kazuhiko Narisawa; Tomoyasu Nishizawa
日本土壌微生物学会2019年度大会, Jun. 2019

高温および有機態窒素条件における Mortierella humilisとその内生細菌がトマト生育に及ぼす影響　　　　　　　　　　　　　　　
松下紗季; 高島勇介; 西澤智康; 太田寛行; 成澤才彦
日本土壌微生物学会2019年度大会, Jun. 2019

Report of undescribed species of the genus Saksenaea isolated from Hahajima in Ogasawara islands and its bacterial endosymbiont related to Burkholderia　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Tomoyasu Nishizawa; Hiroyuki Ohta; Kazuhiko Narisawa
平成31年度 日本菌学会関東支部 年次大会, 20 Apr. 2019

〔Major achievements〕Prevalence and phylogeny of endofungal bacteria associated with species of Mortierella　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima
Japan-Taiwan International Joint Symposium and Workshop [The 33rd Symposium of the Kanto Branch of the Mycological Society of Japan], 08 Dec. 2018, [Invited]

駒止湿原開墾跡地におけるブナ生育に関わる共生菌類の探索と植樹試験への利用　　　　　　　　　　　　　　　
猪瀬有美; 高島勇介; 郭永; 坂上伸生; 西澤智康; 渡邊眞紀子; 成澤才彦
第17回世界湖沼会議, 18 Oct. 2018

Correlations between vegetation and soil microbiome across a vegetation gradient on the deforested land adjacent to the Komado-Shitsugen moor in Japan　　　　　　　　　　　　　　　
Yong Guo; Nobuo Sakagami; Yusuke Takashima; Tomoyasu Nishizawa; Kazuhiko Narisawa; Makiko Watanabe
ISME17, 16 Aug. 2018

糸状菌内生細菌Mycoavidusの二次代謝産物生合成遺伝子の系統解析　　　　　　　　　　　　　　　
郭永; Dilruba Sharmin; 高島勇介; 成澤才彦; 太田寛行; 西澤智康
日本土壌微生物学会2018年度大会, Jun. 2018
20180616, 20180617

Mortierella属菌とその内生細菌がトマト生育に及ぼす影響　　　　　　　　　　　　　　　
松下紗季; 高島勇介; 西澤智康; 太田寛行; 成澤才彦
日本土壌微生物学会2018年度大会, 16 Jun. 2018

Genomic analysis of a newly-cultured endohyphal bacterium Mycoavidus strain dwelling in the soil fungus Mortierella parvispora　　　　　　　　　　　　　　　
郭永; 高島勇介; 成澤才彦; 太田寛行; 西澤智康
第12回日本ゲノム微生物学会年会, Mar. 2018

カビを操る内生細菌－菌類に内生する細菌が宿主をコントロールする？　　　　　　　　　　　　　　　
松下紗季; 高島勇介; 成澤才彦
第11回学生サステイナビリティフォーラム, 27 Feb. 2018

駒止湿原開墾跡地のブナ生育に関わる共生菌類の探索　　　　　　　　　　　　　　　
猪瀬有美; 郭永; 高島勇介; 坂上伸生; 渡邊眞紀子; 成澤才彦
菌根研究会2017年度大会（JCOM2017）, 09 Dec. 2017

駒止湿原開墾跡地の植生回復を目的としたブナ外生菌根部からの菌類の獲得　　　　　　　　　　　　　　　
猪瀬有美; 郭永; 高島勇介; 坂上伸生; 渡邊眞紀子; 成澤才彦
環境微生物系学会合同大会2017, Aug. 2017

An EHB Mycoavidus cysteinexigens enhances in vitro carbon utilization by host Mortierella elongata　　　　　　　　　　　　　　　
郭永; 小沼奈那美; 高島勇介; Dilruba Sharmin; 佐藤嘉則; 成澤 才彦; 真鍋理一郎; 高島昌子; 大熊盛也; 太田寛行; 西澤智康
環境微生物系学会合同大会2017, Aug. 2017

共に生きる菌類と細菌—内生細菌は宿主菌類をどう変えるのか?−　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 成澤才彦
環境微生物系 学会合同大会2017 企画シンポジウムS06: 共生微生物—我々の理解はどこまで進んだのか?, Aug. 2017, [Invited]

北海道および長野県より分離されたMortierella属1未記載種によるホモタリックな接合胞子形成　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 出川洋介; 太田寛行; 成澤才彦
平成29年度日本菌学会関東支部年次大会, 15 Apr. 2017

共に生きる菌類と細菌：ミクロな遭遇が宿主菌類に与える影響
高島勇介
第１回茨城大学重点研究ジョイントシンポジウム, 09 Mar. 2017

駒止湿原開墾跡地におけるブナ外生菌根菌の分布　　　　　　　　　　　　　　　
猪瀬有美; 郭永; 高島勇介; 坂上伸生; 成澤才彦
菌根研究大会2016年度大会, 10 Dec. 2016

Mortierella属菌に内生する細菌Mycoavidus spp.が宿主の胞子嚢形成に与える影響について　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 太田寛行; 成澤才彦
日本微生物生態学会第31回大会, Oct. 2016
20161022, 20161025

真菌類菌糸圏から分離したBurkholderia属細菌のキチン分解活性について　　　　　　　　　　　　　　　
中西布美子; 高島勇介; 菊池義智; 出川洋介; 成澤才彦
日本微生物生態学会第31回大会, Oct. 2016

Mortierella parvisporaに内生するMycoavidus属細菌による宿主の接合胞子形成の阻害　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 太田寛行; 成澤才彦
日本菌学会第60回大会, Sep. 2016

Mortierella属糸状菌に内生する細菌の多様性解析　　　　　　　　　　　　　　　
生田目光; 高島勇介; 佐藤嘉則; 西澤智康; 成澤才彦; 太田寛行
日本土壌微生物学会2016年度大会, Jun. 2016
20160611, 20160612

Mortierella属菌に内生するMycoavidus属細菌の胞子嚢胞子への移行性について　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介
第3回菌類内生細菌情報交換会, Mar. 2016

グロムス門およびケカビ亜門菌類に内生するバクテリアの多様性　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 成澤才彦
日本微生物生態学会第30回大会, Oct. 2015

Mollicutes-related endobacteriaはケカビ亜門菌類3目すべてに内生する　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 成澤才彦
2015年度菌根研究会大会, Oct. 2015

〔Major achievements〕Detection of Mollicutes-related endobacteria from putative saprotrophic Endogone spp. and Sphaerocreas pubescens　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Kohei Yamamoto; Kensuke Seto; Yousuke Degawa; Kazuhiko Narisawa
The 8th International Conference on Mycorrhiza (ICOM8), Aug. 2015
20150803, 20150807

ケカビ目菌類から検出されたBurkholderia属細菌について　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 伊藤英臣; 菊池義智; 広瀬大; 成澤才彦
日本土壌微生物学会2015年度大会, May 2015
20150522, 20150523

Endogone属菌およびSphaerocreas pubescensにおけるMollicutes-related endobacteriaの検出　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 山本航平; 瀬戸健介; 出川洋介; 成澤才彦
日本菌学会第59回大会, May 2015
20150515, 20150518

接合菌類および子嚢菌類における菌類内生バクテリアの検出率について　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 出川洋介; 成澤才彦
環境微生物系合同大会2014, Oct. 2014

Conservation of Endangered “Lower” Plants in the Tropical Area -A study of Fungal Symbiosis with Huperzia spp. in Indonesia-　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima
2013 INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON AGRICULTURAL EDUCATION FOR SUSTAINABLE DEVELOPMENT（Ag-ESD）, Nov. 2013

The occurrence of unique morphologies of Arbuscular Mycorrhizal Fungi associated with Huperzia spp. in Mt. Pangrango, West Java, Indonesia　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa; Iman Hidayat; Gayuh Rahayu
International Symposium on Tropical Fungi 2013, Sep. 2013

Arbuscular Mycorrhiza colonization status of Huperzia spp. in Mt. Pangrango, West Java, Indonesia　　　　　　　　　　　　　　　
Yusuke Takashima; Kazuhiko Narisawa; Iman Hidayat; Gayuh Rahayu
The 9th International Flora Malesiana Symposium, Aug. 2013

Cunninghamella elegansに内生するBurkholderia属細菌について　　　　　　　　　　　　　　　
高島勇介; 親泊貴志; 佐藤嘉則; 出川洋介; 成澤才彦
日本菌学会第56回大会, May 2012

筑波大学生物学学位プログラム（博士前期課程）先端生物学セミナー　　　　　　　　　　　　　　　
Jun. 2022
University of Tsukuba

Biodiversitas Cendawan (Bio 220)　　　　　　　　　　　　　　　
Nov. 2020
Institut Pertanian Bogor

Sep. 2019
筑波大学

Sep. 2018
筑波大学

Jan. 2025 - Present, American Society for Microbiology

Apr. 2023 - Present, Japan Society for Microbial Resources and Systematics (JSMRS)

May 2015 - Present, JAPANESE SOCIETY OF SOIL MICROBIOLOGY

Feb. 2012 - Present, THE MYCOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN

Aug. 2011 - Present, THE JAPANESE SOCIETY OF MICROBIAL ECOLOGY

菌類を宿主とする細胞内共生細菌から迫る共生と寄生の可変性とその進化プロセス（代表）
若手研究
筑波大学
Apr. 2023 - Mar. 2027

Implementation of the detection techniques for endobacteria within fungal mycelia　　　　　　　　　　　　　　　
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
Apr. 2025 - Mar. 2026

Development of the detection for endobacteria within mycelia of Rhizopus microsporus, the causative agent of mucormycosis　　　　　　　　　　　　　　　
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
Apr. 2024 - Mar. 2025

ムコール症原因真菌における細胞内共生細菌 の保有実態とその多様性、および宿主伝搬性 の解明（代表）　　　　　　　　　　　　　　　
Apr. 2023 - Mar. 2025

Molecular ecology of reproductive isolation in fungi from the perspective of reproductive interference by endofungal bacteria
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
08 Mar. 2023 - 31 Mar. 2024

Mortierella属菌の植物共生を制御する内生細菌の機能解明とその利用
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
Ibaraki University
Apr. 2022 - Mar. 2024

高機能バイオ炭等の供給・利用技術の確立（協力）　　　　　　　　　　　　　　　
国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
Apr. 2023

山岳域における伝統的発酵技術のアーカイブ化（協力）
筑波大学
Apr. 2022 - Mar. 2023

Molecular ecology of reproductive isolation in fungi from the perspective of reproductive interference by endofungal bacteria
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
University of Tsukuba
Apr. 2020 - Mar. 2023

Interaction between fungi, algae and bacteria - elucidation of the factors for terrestrialization and explosive diversification of fungi -
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
University of Tsukuba
Apr. 2019 - Mar. 2022

山国信州東信地域の発酵食品生産のための有用微生物菌株コレクションの確立（協力）
筑波大学
Apr. 2020 - Mar. 2021

祖先的菌類における新規共生系の発見を目指した蛍光イメージング手法の確立（代表）　　　　　　　　　　　　　　　
旅費支給（新型コロナウイルス蔓延のため実施断念）
筑波大学産学科学センター菅平高原実験所
Apr. 2020 - Mar. 2021

菌類寄生および共生細菌による宿主の生殖操作に関する研究（代表）
Apr. 2016 - Mar. 2018

菌類内生バクテリアは原始的植物共生菌類の植物応答をコントロールするのか？ （代表）※日本学術振興会特別研究員（DC2）に採用されたため辞退　　　　　　　　　　　　　　　
茨城大学
Apr. 2016 - Mar. 2017

インドネシアにおけるケカビ亜門菌類の多様性調査およびDNAバーコーディング（代表）　　　　　　　　　　　　　　　
東京農工大学大学院（配置大学: 茨城大学）
Sep. 2015

Detection of Mollicutes-related endobacteria from putative saprotrophic Endogone spp. and Sphaerocreas pubescens.　　　　　　　　　　　　　　　
Jun. 2015