Yasuhito SHOMURAAssociate Professor

■Researcher basic information

Organization

  • College of Engineering Department of Materials Science and Engineering
  • Graduate School of Science and Engineering(Master's Program) Major in Quantum Bean Science
  • Graduate School of Science and Engineerin(Doctoral Program) Major in Quantum Bean Science
  • Faculty of Applied Science and Engineering Domain of Materials Science and Engineering

Research Areas

  • Life sciences, Biophysics, Biophysics
  • Life sciences, Functional biochemistry, Functional biological chemistry
  • Life sciences, Structural biochemistry, Structural biochemistry

Degree

  • 2003年03月 博士(理学)(京都大学)
  • 2000年03月 修士(理学)(京都大学)

Educational Background

  • 01 Apr. 2000 - 31 Mar. 2003, 京都大学, 大学院理学研究科, 化学専攻
  • Apr. 2000 - Mar. 2003, 京都大学, 大学院理学研究科, 化学専攻
  • 01 Apr. 1998 - 31 Mar. 2000, 京都大学, 大学院理学研究科, 化学専攻
  • Apr. 1998 - Mar. 2000, 京都大学, 大学院理学研究科, 化学専攻
  • Apr. 1994 - Mar. 1998, 静岡大学, 理学部, 化学科

Career

  • Apr. 2015, 茨城大学 大学院理工学研究科, 准教授
  • Oct. 2005 - Mar. 2015, 兵庫県立大学 大学院生命理学研究科, 助手/助教
  • Apr. 2003 - Sep. 2005, マックスプランク生化学研究所, 博士研究員

Member History

  • Jan. 2016, 実行委員, 日本結晶学会平成28年度年会

■Research activity information

Paper

MISC

Books and other publications

  • ADVANCES IN BIOORGAOMETALLIC CHEMISTRY,Chapter 18 "Structural Insights into the Protective Mechanisms against O2 in the [NiFe]-Hydrogenases"               
    Joint work
    ELSEVIER, 2019
  • Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry,Standard Article "NAD+-reducing [NiFe]-Hydrogenase"               
    Shomura Y.; Higuchi Y., Single work
    Wiely, 2019
  • ADVANCES IN BIOORGAOMETALLIC CHEMISTRY Chapter 18 "Structural Insights into the Protective Mechanisms against O2 in the [NiFe]-Hydrogenases"               
    Joint work
    ELSEVIER, 2019
  • Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry Standard Article "NAD+-reducing [NiFe]-Hydrogenase"               
    Shomura Y; Higuchi Y, Single work
    Wiely, 2019

Lectures, oral presentations, etc.

  • Mn-カタラーゼにおける過酸化水素不均化反応機構の解明に向けて               
    庄村康人
    2022年度iBIX-JAXA-KEK物構研-QST 合同タンパク質研究会, 27 Feb. 2023, [Invited]
    20230227, 20230227
  • Structure analysis of the Mn-catalase like protein from an anaerobic bacterium               
    野村 葵、門倉 佳輝、庄村 康人
    第22回日本蛋白質科学年会, 07 Jun. 2022
    20220607, 20220609
  • Elucidation of the structure-function relationship of the Ni-substituted rubredoxin mutant               
    遠藤 啓貴、横山 優花、松井 眞美、飯塚 夏海、庄村 康人
    第22回日本蛋白質科学年会, 07 Jun. 2022
    20220607, 20220609
  • Ni置換型ルブレドキシン変異体のX線・中性子結晶子構造解析               
    遠藤啓貴; 庄村康人
    2021年度量子ビームサイエンスフェスタ, 08 Mar. 2022
  • X-ray crystal structure analysis of the Ni-substituted rubredoxin mutant               
    Keiki Endo; Yuka Yokoyama; Mami Matsui; Natsumi Iitsuka; Yasuhito Shomura
    6th International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 22 Feb. 2022
  • 還元型Mn-カタラーゼのX線・中性子結晶構造解析               
    鈴井美羽,高木夕里圭,高野紗和,高橋果林,山田太郎,庄村康人
    令和3年度 日本結晶学会年会, 19 Nov. 2021
  • Clostridium acetobutylicum由来Rubrerythrinの構造解析               
    伊藤拓未,川崎信治,庄村康人
    2020年度量子ビームサイエンスフェスタ, 10 Mar. 2021
  • 高度好熱菌由来Mn-カタラーゼの結晶構造解析               
    高木夕里圭,高野紗和,高橋果林,山田太郎,庄村康人
    2020年度量子ビームサイエンスフェスタ, 10 Mar. 2021
  • Structure analyses of Rubrerythrin from Clostridium acetobutylicum               
    Takumi Itoh; Yasuhito Shomura
    5th International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 19 Nov. 2020
  • Ni結合型ルブレドキシンの物性・機能相関の解明               
    庄村康人
    2020年度iBIX-JAXA-KEK 物構研-QST 合同タンパク質研究会, 09 Nov. 2020, [Invited]
  • Improved hydrogen evolution activity of the Ni-substituted rubredoxin by site-directed mutagenesis               
    Yasuhito Shomura; Yuka Yokoyama
    The 70th JSCC Conference, 28 Sep. 2020, 錯体化学会, [Invited]
    20200928, 20200930
  • Mn-カタラーゼへの部位特異的変異導入とその酵素学的解析               
    高野紗和; 高橋果林; 山田太郎; 庄村康人
    第19回日本蛋白質科学年会, 24 Jun. 2019
  • Ni置換型ルブレドキシンのX線・中性子結晶構造解析               
    横山優花; 庄村康人
    2018年度量子ビームサイエンスフェスタ, 12 Mar. 2019
  • L-アミノ酸リガーゼを用いた生理活性ペプチドのin vivo合成系の確立               
    清野里々花; 矢ヶ崎誠; 庄村康人
    日本農芸化学会関東支部2018年度大会, 03 Oct. 2018
  • 放線菌由来シトクロムP450の基質特異性の解明               
    樋澤芽依; 纐纈健人; 庄村康人
    日本農芸化学会関東支部2018年度大会, 03 Oct. 2018
  • [NiFe]ヒドロゲナーゼがもつ鉄硫黄クラスターの新規機能               
    庄村康人
    第56回日本生物物理学会, 15 Sep. 2018, [Invited]
  • Oxidation-induced conformational change at the active site of the soluble NAD+-reducing [NiFe]-hydrogenase               
    Yasuhito Shomura
    43rd International Conference on Coordination Chemistry, 30 Jul. 2018, [Invited]
  • X線小角散乱法による コラーゲンプロリンtrans-4-水酸化酵素の構造解析               
    宗田善久; 庄村康人
    第18回日本蛋白質科学会年会, 26 Jun. 2018
  • In vivo synthesis of physiologically active peptides using the protein-engineered L-amino acid ligase               
    Ririka Seino; Makoto Yagasaki; Yasuhito Shomura
    3rd International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 30 May 2018
  • Quaternary structure prediction of collagen prolyl trans-4-hydroxylase by SAXS analysis               
    Yoshihisa Soda; Yasuhito Shomura
    3rd International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 30 May 2018
  • Crystal structure analysis of the nickel-Substituted rubredoxin from Caldanaerobacter subterraneus               
    Yuka Yokoyama; Yasuhito Shomura
    3rd International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 30 May 2018
  • Structural studies on [NiFe]-hydrogenases               
    Yasuhito Shomura
    3rd International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 30 May 2018, [Invited]
  • X線小角散乱法によるコラーゲンプロリンtrans-4-水酸化酵素の構造解析               
    宗田善久; 庄村康人
    2017年度量子ビームサイエンスフェスタ, 02 Mar. 2018
  • Small angle X-ray scattering analysis of collagen prolyl trans-4-hydroxylase               
    Yoshihisa Soda; Yasuhito Shomura
    2nd International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 08 Dec. 2017
  • X-ray structure analysis of cytochrome P450 from Stackebrandtia nassauensis               
    Mei Hizawa; Kento Koketsu; Yasuhito Shomura
    2nd International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 08 Dec. 2017
  • Biosynthesis of the organometallic compound: the maturation processes of [NiFe]-hydrogenases               
    Yasuhito Shomura
    The International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 20 Nov. 2016, [Invited]
  • X-ray structure analysis of the HypCD complex in the metal-bound forms               
    Masashi Sawabe; Yoshiki Higuchi; Yasuhito Shomura
    The International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 18 Nov. 2016
  • X-ray structure analysis of the dipeptide synthetase RSp1486a               
    Mei Hizawa; Makoto Yagasaki; Yoshiki Higuchi; Yasuhito Shomura
    The International Symposium of Quantum Beam Science at Ibaraki University, 18 Nov. 2016
  • Fe(CN)2CO 錯体の生合成に関与するHypCD複合体の二価金属結合型構造               
    澤辺大嗣; 樋口芳樹; 庄村康人
    平成28年度 日本結晶学会年会, 17 Nov. 2016
  • ジペプチド合成酵素RSp1486aのX線結晶構造解析               
    樋澤芽依; 矢ケ崎誠; 樋口芳樹; 庄村康人
    平成28年度 日本結晶学会年会, 17 Nov. 2016
  • ヒドロゲナーゼがもつ鉄硫黄クラスターの構造的多様性               
    庄村康人; Noor Dina Binti Muhd Noor; 西川幸志; 樋口芳樹
    第88回 日本生化学会大会, 01 Dec. 2015, [Invited]
  • Fe(CN)2CO 錯体の生合成に関与するHypCD複合体のFe結合型構造               
    庄村康人; 樋口芳樹; Robert Szilagyi
    平成27年度 日本結晶学会年会, 17 Oct. 2015
  • X-ray structure analysis of the [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter sp. S-77               
    Yasuhito Shomura
    I2CNER International Workshop 2015, 04 Feb. 2015, [Invited]
  • Ni-Fe型水素分解酵素の構造化学的研究               
    庄村康人
    異分野融合若手研究者Science & Technology クラブ, 26 Jan. 2015, [Invited]
  • Development of the Heterologous Expression System of the Group IV [NiFe]-hydrogenase               
    Yasuhito Shomura
    ICARP(International Conference on Artficial Photosynthesis), 26 Nov. 2014
  • 膜結合型[NiFe]-ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明               
    庄村康人; 尹基石; 西原宏史; 樋口芳樹
    21世紀播磨科学技術フォーラム, 24 Jul. 2014
  • X線結晶構造解析によるL-プロリンcis-4-水酸化酵素の位置選択性の解明               
    庄村康人; 纐纈健人; 樋口芳樹
    第6回日本生物物理学会 中国四国支部大会, 17 May 2014
  • [NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析               
    庄村康人
    第27回 日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム, 11 Jan. 2014, [Invited]

Affiliated academic society

  • 日本結晶学会
  • 日本蛋白質科学会
  • 日本農芸化学会

Research Themes

  • グループⅣ[NiFe]ヒドロゲナーゼの水素合成-プロトンポンピング共役機構の解明               
    基盤研究(C)
    2019 - 2021
  • .               
    特別推進研究
    Apr. 2014 - Mar. 2019
  • .               
    基盤研究(C)
    Apr. 2013 - Mar. 2016